Preparando 2009.

O primeiro reforço do São Paulo para 2009 é o lateral Wagner Diniz do Vasco. O jogador foi anunciado após o jogo que deu o título Brasileiro para o São Paulo.

O jogador fez três gols no campeonato e jogou os últimos quatro torneios nacionais pelo Vasco. Neste ano, participou da campanha que rebaixou a equipe carioca para a Série B.

A lateral direita foi um problema para o São Paulo na temporada. Um dos jogadores mais utilizados na posição foi o volante Zé Luis, mesmo depois de o time ter contratado os laterais-direito Joilson e Jancarlos.

O Titulo Nacional.

Após uma temporada complicada, o São Paulo mais uma vez termina o ano com o título nacional, com uma recuperação desacreditada até pelos mais fanáticos torcedores tricolores. Chegou a estar 11 pontos do até então líder Gremio, e com um um por cento de chance de ser campeão análisados pelos matemáticos.
O TRI-HEXA campeonato do São Paulo não veio antecipadamente como nos anos anteriores, mas a ultima rodada deixou os tricolores paulistas e gauchos com uma ansiedade muito grande. O São Paulo precisava de um simples empate para levar o título, mas venceu o jogo contra o Goias em Brasília po 1x0, dessa forma a vitoria do Gremio sobre o Atletico MG no olimpico por 2x0 não serviu para tirar a taça do São Paulo.